Yazar "Kaya, Mehmet Salih" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 7 / 7
  • [ X ]
    Öğe
    Circulating miRNAs as potential molecular biomarker of early pregnancy in ewes
    (Wiley, 2018) Köse, Mehmet; Kaya, Mehmet Salih; Kırbaş, Mesut; Dursun, Şükrü; Hitit, Mustafa; Alak, İlyas; Atlı, Mehmet Osman
    [Abstract Not Available]
  • Küçük Resim
    Öğe
    Circulating miRNAs in maternal plasma as potential biomarkers of early pregnancy in sheep
    (Frontiers Media SA, 2022) Hitit, Mustafa; Köse, Mehmet; Kaya, Mehmet Salih; Kırbaş, Mesut; Dursun, Şükrü; Alak, İlyas; Atlı, Mehmet Osman
    MicroRNA (miRNA) plays an important role in the control of gene expression and is implied in many biological functions, including embryo implantation and development. The aim was to assess plasma miRNA profiles during the peri-implantation and ascertain potential candidate miRNA markers for early pregnancy diagnosis in ovine plasma. The plasma samples were obtained from a total of 24 ewes on days 12 (pre-implantation; P12, n = 4), 16 (implantation; P16, n = 4) and 22 (post-implantation; P22, n = 4) after mating, and on their corresponding days of 12 (Pre-C; C12, n = 4), 16 (Imp-C; C16, n = 4) and 22 (Post-C; C22, n = 4) of the estrous cycle. The miRNA profiles in plasma were assessed by microarray technology. We detected the presence of 60 ovine-specific miRNAs in plasma samples. Of these miRNAs, 22 demonstrated a differential expression pattern, especially between the estrous cycle and early pregnancy, and targeted 521 genes. Two miRNAs (oar-miR-218a and oar-miR-1185-3p) were confirmed using RT-qPCR in the ovine plasma samples. Protein-protein interaction (PPI) network of target genes established six functional modules, of which modules 1 and 3 were enriched in the common GO terms, such as inflammatory response, defense response, and regulation of immune response. In contrast, module 2 was enriched in the developmental process involved in reproduction, embryo development, embryonic morphogenesis, and regulation of the developmental process. The results indicate that miRNAs profiles of plasma seemed to be modulated during the peri-implantation stage of pregnancy in ewes. Circulating miRNAs could be promising candidates for diagnosis in early ovine pregnancy.
  • [ X ]
    Öğe
    Early pregnancy regulates genes of hyaluronan system in ovine endometrium
    (Wıley-Blackwell, 2016) Kıyma, Zekeriya; Hitit, Mustafa; Köse, M.; Kaya, Mehmet Salih; Kırbaş, M.; Dursun, Şükrü; Atlı, Mehmet O.; Güzeloğlu, A.
    [Abstract Not Available]
  • Küçük Resim
    Öğe
    Expression pattern of microRNAs in ovine endometrium during the peri-implantation
    (Elsevier Inc., 2022) Köse, Mehmet; Hitit, Mustafa; Kaya, Mehmet Salih; Kırbaş, Mesut; Dursun, Şükrü; Alak, İlyas; Atlı, Mehmet Osman
    MicroRNA (miRNA), acting as the transcriptional regulator of gene expression, has been widely demonstrated to be involved in many biological functions, including embryo implantation and development. The objective of the current study was to illuminate the expression pattern of microRNAs (miRNAs) in the endometrium during the peri-implantation in ewes. Intercaruncular endometrial samples was obtained from a total of 24 ewes on days of 12 (pre-implantation, n = 4), 16 (implantation, n = 4) and 22 (post-implantation, n = 4) of pregnancy following mating, and on their corresponding days of 12 (n = 4), 16 (n = 4) and 22 (n = 4) of the estrous cycle. The miRNA profiles were examined in the endometrium by microarray technology. We detected 116 ovine specifics miRNAs in the endometrium. Of these, nineteen were differentially expressed in early pregnancy. Four miRNAs (oar-miR-370-3p, oar-miR-411b-5p, oar-miR-379-3p and oar-miR-411a-3p) that had the most differential fold change were confirmed by RT-qPCR in ovine endometrium. The differentially expressed miRNAs targeted a total of 315 genes, resulting in 39 GO terms in molecular function, 353 in biological process, and 17 in the cellular component. The construction of the PPI network of target genes established two functional modules mostly enriched in the innate immune system, toll receptor cascades in module 1, whereas genes in module 2 were associated with GMCSF-mediated signaling events, insulin pathway, and mTOR signaling pathway. Based on the results, we may imply that miRNAs modulate ovine endometrium during the peri-implantation.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Expression profiles of critical miRNAs in ovine endometrium during the peri-implantation
    (Wiley, 2018) Dursun, Şükrü; Köse, Mehmet; Kaya, Mehmet Salih; Kırbaş, M.; Hitit, Mustafa; Alak, I.; Atli, Mehmet O.
    [Abstract Not Available]
  • Küçük Resim
    Öğe
    Koyunlarda maternal plazmadan fötal cinsiyet tayininde fenol-kloroform izolasyon metodu ile iki farklı ticari izolasyon kitinin kullanılabilirliği
    (Harran Üniversitesi, 2016) Kaya, Mehmet Salih; Bozkaya, Faruk; Köse, Mehmet; Dursun, Şükrü; Kırbaş, Mesut; Bülbül, Bülent; Aydilek, Nurettin; Bayrıl, Tahir; Atlı, Mehmet Osman
    Koyunlarda fötal cinsiyetin belirlenmesinde kullanılan yöntemlerden biri maternal plazmadaki fötal DNA’ların Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile çoğaltılmasına dayanır. Ancak, maternal plazmadan izole edilen DNA miktarı ve kalitesi, kullanılan DNA izolasyon yöntemine göre önemli ölçüde değişebilmektedir. Bu çalışmada, üç farklı DNA izolasyon metoduyla koyun maternal plazmasından izole edilen DNA’ların PZR ile çoğaltılarak fötüs cinsiyetlerinin belirlenmesi amaçlandı. Bu amaçla, gebeliğin 20. haftasındaki 13 adet koyundan plazma örnekleri alındı ve doğum sonrası yavruların cinsiyetleri doğrulandı. Pozitif kontrol amacıyla iki adet koç plazması, negatif kontrol amacıyla ise iki adet gebe olmayan koyun plazması kullanıldı. Maternal plazmadan fenol-kloroform izolasyon metodu ve iki farklı ticari nükleik asit izolasyon kiti (QIAamp ve FitAmp) kullanılarak DNA izole edildi. İzole edilen DNA örneklerinden X ve Y kromozomları üzerindeki Amelogenin ve SRY (Sex-determining Region Y) genlerinin hedef bölgeleri PZR yöntemi ile çoğaltıldı. Ticari nükleik asit izolasyon kitleriyle elde edilen DNA’lardan SRY ve Amelogenin primerleri ile yapılan farklı PZR işlemlerinde fötüs cinsiyetinin belirlenmesine yönelik spesifik PZR ürünleri elde edilemedi. Diğer taraftan, fenol-kloroform izolasyon metoduyla izole edilen DNA örneklerinden 10’unda (7 erkek ve 3 dişi fötal DNA içeren örnekte) fötüs cinsiyeti doğru bir şekilde teşhis edildi (10/13). Ancak erkek fötüs taşıyan üç koyundan elde edilen DNA örneklerinden erkek cinsiyet teşhisine özgü PZR ürünleri elde edilemedi (3/13). Çalışmanın sonuçları koyunlarda maternal plazmadan DNA izolasyonunda iki farklı ticari nükleik asit izolasyon kiti kullanıldığında fötal cinsiyetin tespit edilemediğini, diğer taraftan fenol-kloroform izolasyon metodu ile fötal cinsiyet teşhisi yapılabildiğini, ancak bu metodun da hatalı sonuçlara neden olabildiğini göstermiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    miRNAs expression during the peri-attachment period of pregnancy in the ovine endometrium
    (WILEY-BLACKWELL, 2016) Köse, Mehmet; Özel, Çağlayan; Güzeloğlu, Aydın; Kaya, Mehmet Salih; Kırbaş, Mesut; Dursun, Şükrü; Kıyma, Zekeriya; Atlı, Mehmet Osman
    [Abstract Not Available]