Yazar "Bozkaya, Faruk" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Koyunlarda maternal plazmadan fötal cinsiyet tayininde fenol-kloroform izolasyon metodu ile iki farklı ticari izolasyon kitinin kullanılabilirliği
    (Harran Üniversitesi, 2016) Kaya, Mehmet Salih; Bozkaya, Faruk; Köse, Mehmet; Dursun, Şükrü; Kırbaş, Mesut; Bülbül, Bülent; Aydilek, Nurettin; Bayrıl, Tahir; Atlı, Mehmet Osman
    Koyunlarda fötal cinsiyetin belirlenmesinde kullanılan yöntemlerden biri maternal plazmadaki fötal DNA’ların Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile çoğaltılmasına dayanır. Ancak, maternal plazmadan izole edilen DNA miktarı ve kalitesi, kullanılan DNA izolasyon yöntemine göre önemli ölçüde değişebilmektedir. Bu çalışmada, üç farklı DNA izolasyon metoduyla koyun maternal plazmasından izole edilen DNA’ların PZR ile çoğaltılarak fötüs cinsiyetlerinin belirlenmesi amaçlandı. Bu amaçla, gebeliğin 20. haftasındaki 13 adet koyundan plazma örnekleri alındı ve doğum sonrası yavruların cinsiyetleri doğrulandı. Pozitif kontrol amacıyla iki adet koç plazması, negatif kontrol amacıyla ise iki adet gebe olmayan koyun plazması kullanıldı. Maternal plazmadan fenol-kloroform izolasyon metodu ve iki farklı ticari nükleik asit izolasyon kiti (QIAamp ve FitAmp) kullanılarak DNA izole edildi. İzole edilen DNA örneklerinden X ve Y kromozomları üzerindeki Amelogenin ve SRY (Sex-determining Region Y) genlerinin hedef bölgeleri PZR yöntemi ile çoğaltıldı. Ticari nükleik asit izolasyon kitleriyle elde edilen DNA’lardan SRY ve Amelogenin primerleri ile yapılan farklı PZR işlemlerinde fötüs cinsiyetinin belirlenmesine yönelik spesifik PZR ürünleri elde edilemedi. Diğer taraftan, fenol-kloroform izolasyon metoduyla izole edilen DNA örneklerinden 10’unda (7 erkek ve 3 dişi fötal DNA içeren örnekte) fötüs cinsiyeti doğru bir şekilde teşhis edildi (10/13). Ancak erkek fötüs taşıyan üç koyundan elde edilen DNA örneklerinden erkek cinsiyet teşhisine özgü PZR ürünleri elde edilemedi (3/13). Çalışmanın sonuçları koyunlarda maternal plazmadan DNA izolasyonunda iki farklı ticari nükleik asit izolasyon kiti kullanıldığında fötal cinsiyetin tespit edilemediğini, diğer taraftan fenol-kloroform izolasyon metodu ile fötal cinsiyet teşhisi yapılabildiğini, ancak bu metodun da hatalı sonuçlara neden olabildiğini göstermiştir.
  • [ X ]
    Öğe
    Rediscovery of a new mountain gazelle population and clarification of taxonomic status of the genus Gazella in Turkey using mtDNA sequencing
    (Czech Academy of Sciences, 2012) Kankılıç, Tolga; Özüt, Deniz; Gürler, Şükrü; Kence, Meral; Bozkaya, Faruk; Kence, Aykut
    The fauna of Turkey lists the goitered gazelle (Gazella subgutturosa) as the only species of the genus Gazella, but older records reported another species of gazelle in Anatolia (either G. dorcas or G. gazella). However, the species status and the distribution of the second gazelle species have never been confirmed, and the species has been regarded as extirpated. We studied the nucleotide differences in a 400 bp region of cytochrome-b gene for Şanli{dotless}urfa population and a recently discovered gazelle population in Hatay. A total of 36 sequences were found with 23 variable sites. All individuals from Hatay and the Golan Heights, Israel (G. gazella) revealed an identical monophyletic lineage and the results of phylogenetic analyses suggest that the population in Hatay belongs to G. g. gazella. Şanli{dotless}urfa individuals were grouped with Genbank sequences of G. subgutturosa marica, which a recent study has suggested to be a distinct species, G. marica. Our findings have resolved an ongoing debate on the taxonomic status of the Gazella in Turkey and call for the urgent need of improved conservation efforts for the wild gazelles.